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Simulaciones avanzadas de los efectos de las drogas utilizadas en el tratamiento del SIDA / Francisco Javier Herrero.

Por: Colaborador(es): Detalles de publicación: [S.l. : s.n. ], 2013.Descripción: 70 p. : il. ; 30 cmTema(s): Recursos en línea: Disponible en línea.
Contenidos parciales:
Marco biológico del problema -- Virología -- Antirretrovirales -- Inhibidores de RetroTranscriptasa (RTI) -- Inhibidores de Proteasa (PI) -- Terapia combinada -- Estrategias para eliminación de la infección -- Vorinostat -- Modelo de Perelson, Kirschner y De Boer -- Implementación del Software -- Vectorización de parámetros del modelo -- Desacople de métodos numéricos -- Herramientas para subvectores y submatrices -- Modificación de pasos de simulación dentro de una ejecución -- Modelos y Plugins -- Experimentos -- Modelo Matricial Multicepa -- Perelson extendido matricial -- Consideración de nuevos modelos -- Mejoras de Software -- Performance -- Paralelización -- Accesibilidad -- CCCC -- CLOC -- Cobertura de código.
Nota de disertación: Tesis (Lic. en Ciencias de la Computación)--Universidad Nacional de Córdoba, Facultad de Matemática, Astronomía y Física, 2013. Resumen: Uno de los principales obstáculos para la eliminación del VIH en un paciente es el reservorio de células con infección latente, debido a que los antirretrovirales no actúan en este. Se propone estudiar el tratamiento con antirretrovirales bajo la acción de la droga Vorinostat que promueve la replicación de los viriones, acelerando el proceso de infección y así permitiendo la manifestación del reservorio para convertirlo en blanco para la erradicación. Para esto se revisaron los modelos determinísticos basados en sistemas dinámicos continuos implementados anteriormente en ViSi y se implementaron tres modelos nuevos permitiendo finalmente simular tratamientos con un número arbitrario de cepas e incorporando la distinción entre replicación activa de viriones y estado de división celular de linfocitos por presencia de un antígeno. Para esto también hubo que realizar refactorizaciones en el desarrollo anterior e implementar plugins para generar escenarios de simulación de tratamientos. Finalmente se realizaron cuatro experimentos donde se logró finalmente representar el escenario de eliminación deseado. Resumen: One of the main obstacles for VIH elimination on a patient is the cell reservoir with latent infection, because the antiretrovirals doesn't apply on this. We propose to study antiretrovirals treatment using Vorinostat drug, that promotes virion replication, accelerating the infection process and thus allowing reservoir manifestation to become an erradication blank. To achieve this we review the deterministic models based on continuous dynamic systems implemented before on ViSi and we implement three new models nally allowing to simulate treatments with an arbitrary number of strains and incorporating the distinction between active virions replication and lymphocites cell division on antigen presence. Also for this had to be made refactorizations on previous development and implement plugins to generate treatment simulation scenarios. Finally four experiments where nally able to represent the desired eradication scenario.
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Trabajo Especial de Grado Trabajo Especial de Grado FaMAF Secc. Tesis y Trabajos especiales Trabajo Especial Computación CAJA 19 - 22329 1 Disponible Disponible también en línea 22329
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Incluye índice general y apéndices de acrónimos y métricas.

Tesis (Lic. en Ciencias de la Computación)--Universidad Nacional de Córdoba, Facultad de Matemática, Astronomía y Física, 2013.

Bibliografía : p. 64-65.

Uno de los principales obstáculos para la eliminación del VIH en un paciente es el reservorio de células con infección latente, debido a que los antirretrovirales no actúan en este. Se propone estudiar el tratamiento con antirretrovirales bajo la acción de la droga Vorinostat que promueve la replicación de los viriones, acelerando el proceso de infección y así permitiendo la manifestación del reservorio para convertirlo en blanco para la erradicación. Para esto se revisaron los modelos determinísticos basados en sistemas dinámicos continuos implementados anteriormente en ViSi y se implementaron tres modelos nuevos permitiendo finalmente simular tratamientos con un número arbitrario de cepas e incorporando la distinción entre replicación activa de viriones y estado de división celular de linfocitos por presencia de un antígeno. Para esto también hubo que realizar refactorizaciones en el desarrollo anterior e implementar plugins para generar escenarios de simulación de tratamientos. Finalmente se realizaron cuatro experimentos donde se logró finalmente representar el escenario de eliminación deseado.

One of the main obstacles for VIH elimination on a patient is the cell reservoir with latent infection, because the antiretrovirals doesn't apply on this. We propose to study antiretrovirals treatment using Vorinostat drug, that promotes virion replication, accelerating the infection process and thus allowing reservoir manifestation to become an erradication blank. To achieve this we review the deterministic models based on continuous dynamic systems implemented before
on ViSi and we implement three new models nally allowing to simulate treatments with an arbitrary number of strains and incorporating the distinction between active virions replication
and lymphocites cell division on antigen presence. Also for this had to be made refactorizations on previous development and implement plugins to generate treatment simulation scenarios.
Finally four experiments where nally able to represent the desired eradication scenario.

Disponible en línea.

cc Bajo Licencia Creative Commons Atribución-CompartirIgual 2.5 Argentina. CC BY-SA

http://creativecommons.org/licenses/by-sa/2.5/ar/

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